《劳动法》第二条规定“在中华人民共和国境内的企业、个体经济组织（以下统称用人单位）和与之形成劳动关系的劳动者，适用本法。国家机关、事业组织、社会团体和与之建立劳动合同关系的劳动者，依照本法执行。”因所在单位是事业单位，本案如何定性应该以员工与单位之间的关系的。

根据有关规定,贵单位与该进修员工签订的进修合同可以认定为聘用合同.依据《最高人民法院关于人民法院审理事业单位人事争议案件若干问题的规定》第一条的规定:"事业单位与其工作人员之间因辞职、辞退及履行聘用合同所发生的争议，适用《中华人民共和国劳动法》的规定处理。",因此,贵单位与该进修员工之间的劳动争议应当提起劳动争议仲裁.最好来处理.